駐車場が謄本上、畑となっているのですがいいのでしょうか？

いいえ。土地の地目が畑といった農地の場合、駐車場として認められません。産業廃棄物収集運搬業許可関係なく、駐車場として使用している場合など、速やかに農地転用の手続きを行ってください。